debian/rulesで、 libgdbm3_1.8.3-2.1_m32r.deb用のデータを 個別にコピーして作っていた部分を、make installで コピーするようにしたために、 libgdbm-dev_1.8.3-2.0.1_m32r.debで提供すべきファイルが コピーされて、パッケージインストール時に trying to overwrite `/usr/lib/libgdbm.a', which is also in package libgdbm-dev のエラーを発生します。 libgdbm3_1.8.3-2.0.1_m32r.debでは発生しません。